La paraula endèmia té els seus orígens en el grec, provinent de la veu "ἐνδημία", al·ludint a un "fenomen que afecta un país", compost pel sufix "en" fent referència a donar intensitat més l'entrada "dem" que equival a "poble". La endèmia pot ser descrita com una malaltia que s'estableix en un territori o regió d'una manera repetitiva i habitual afectant així a la població d'aquesta entitat o territori geogràfic per un període de temps llarg. Es tracta d'un procés patològic que perjudica a un nombre considerable d'individus mantenint-se per molt temps en una zona geogràfica i en general consisteix en malalties o afeccions infeccioses.
La diferència d'aquest fenomen amb una epidèmia, és que aquest últim generalment fa referència a la a parició d'una malaltia de tipus infecciosa que es contagia de forma ràpida dins d'un territori o població en específic, però limitada. D'altra banda es tendeix a confondre aquest terme endèmia amb la pandèmia, però es diferencia pel fet que una pandèmia pot descriure com una epidèmia generalitzada, és a dir pot afectar més d'un continent.
Exemples d'endèmies poden ser el cas de la malària en països tropicals o de clima càlid com a Àfrica, països d'Amèrica o el Sud-est asiàtic. Al continent americà ha un cas particular d'endèmia al Brasil, que és la febre groga de l'Amazones. És important esmentar que durant el període d'infestació de la malaltia, és estrictament obligatori realitzar la vacunació corresponent abans de visitar el lloc o la regió infectada.
