En l'àmbit de la infectologia, un patogen és un element capaç d'originar una malaltia a la biologia d'un hoste, ja sigui un humà, animal o planta. Hi ha diversos factors que fan que l'hoste sigui més propens a ser envaït per un patogen, aquests poden ser: factors genètics, estil de vida, l'edat, higiene personal, consum de tòxics (tabac, alcohol, drogues, etc.).
Entre els agents patògens més comuns estan:
Els virus: són agents infectocontagiosos amb una estructura no metabolitzada, compost per àcids nucleics i proteïnes. Són paràsits que han infectar altres cèl·lules per poder reproduir-se, de manera que no es troben vinculats amb el medi. Exemple: el xarampió, la varicel·la, la sida, la grip, la poliomielitis, etc.
Els fongs: representen organismes pluricel·lulars eucariòtics, que es troben compostos per cèl·lules. Exemple: candidiasi, peu d'atleta, etc.
Els bacteris: representen organismes unicel·lulars procariòtics que no presenten un nucli diferenciat, per produir malalties originades per bacteris es fan servir els antibiòtics, moltes de les quals es produeixen, poden tractar-se, però hi ha altres que no, pel que resulten molt contagioses. Exemple: Mycobacterium tuberculosi, salmonel·losi, etc.
Els protozous: són organismes unicel·lulars eucariòtics, amb nucli diferenciat i capaç d'originar infeccions. Exemple: malària, mal de Chagas, etc.
Un agent patogen s'adequa a l'hoste per beneficiar-se'n, de manera que l'hoste resulta perjudicat. A més de cobrir les seves necessitats vitals, un agent patogen buscarà la manera de reproduir la seva espècie a través de l'hoste.
És important destacar que la patogenicitat de l'ens es trobarà controlada, segons la fortalesa immunitària de l'hoste. Aquells individus que es trobin vacunats correctament tindran cert avantatge per afrontar a aquests agents patògens, ja que el sistema immune de cada organisme serà la clau o l'impediment per al progrés de qualsevol malaltia.
Com s'ha dit anteriorment, l'estil de vida i el comportament de l'hoste, solen ser determinants a l'hora de contraure una afecció, de manera que és important tenir bons hàbits d'higiene, anar amb compte amb els aliments que s'ingereixen, deixar el consum d'alcohol i altres drogues o qualsevol altra activitat que promogui l'aparició o contagi d'un agent patogen.