Es descriu com microorganisme aeròbic a el tipus d'organisme que tingui la necessitat estricta de l'consum d'oxigen diatòmic per poder viure, se'ls cataloga com a organisme aeròbic facultatiu quan pot viure o no amb la presència d'oxigen.
El adjectiu de aerobi no només és aplicat per a la classificació d'un organisme també pot ser utilitzat per a la descripció d'un ambient o d'un reacció metabòlica designant-li el nom de "ambient aeròbic" i "metabolisme aerobi" respectivament, en ambdues situacions l'oxigen es troba present en abundants quantitats, (designant d'ambient microaeròfils quan hi ha oxigen en petites quantitats però no es troba inexistent), com a exemple de metabolisme aeròbic es pot citar la fotosíntesioxigènica la qual aporta grans quantitats d'oxigen a l'ambient del qual oxigen és aprofitat per les cèl·lules eucariotes gràcies a la presència del mitocondri s'encarrega de realitzar el procés de respiració cel·lular.
Aquest terme és principalment usat en la classificació de microorganismes patògens com ara els bacteris, els bacteris aeóbicas com el seu cognom ho indica tenen necessitat d'habitar ambients rics en oxigen diatòmic per poder créixer, proliferar i diferenciar-se oportunament, és a dir, són un tipus de bacteris que realitzen la respiració cel·lular, d'acord a la necessitat d'oxigen podem classificar-les en diversos grups: bacteris aerobis estrictes (aerobis obligats) aquests requereixen oxigen per realitzar els seus processos metabòlics, bacteris anaerobis facultatius poden utilitzar l'oxigen i al seu torn també treballen sense, bacteris microaeròfilsempren l'oxigen a baixes concentracions, bacteris aerotolerantes poden viure en presència d'oxigen però no el fan servir metabòlicament.
